Władze uczelni
Rektor
Prezydent kieruje uczelnią oraz reprezentuje ją na zewnątrz. Od 3 grudnia 2014 r. prezydentem Viadriny jest prof. Alexander Wöll.
Kanclerz
Kanclerz jest zwierzchnikiem administracji uniwersytetu i odpowiada za budżet uczelni. Kanclerzem Viadriny jest Christian Zens.
Prorektorzy
Prof. Dr. Stephan Kudert
Prof. Dr. Cornelia Müller
Janine Nuyken
Rektorat
Senat
Senat jest centralnym organem uczelni, składającym się z profesorów, studentów oraz pracowników naukowych i zwykłych.
Rady wydziałów
Rada Wydziału Prawa
Rada Wydziału Kulturoznawstwa
Rada Wydziału Ekonomii
Rzeczniczka ds. równouprawnienia
Rzecznik ds. równouprawnienia, p. Marion Gerhardt, zajmuje się kwestiami równouprawnienia kobiet i mężczyzn na uniwersytecie.
Rzeczniczka ds. obcokrajowców
Dr Carmen Thiele, reprezentuje interesy obcokrajowców na Uniwersytecie Europejskim Viadrina oraz udziela im konsultacji.
Rzeczniczka ds. niepełnosprawnych