Władze uczelni
Rektor
Prezydent sprawuje kierownictwo nad uczelnią oraz reprezentuje ją na zewnątrz. Od 2008 r. prezydentem Viadriny jest dr Gunter Pleuger.
Kanclerz
Kanclerz jest zwierzchnikiem administracji uniwersytetu. Jest on odpowiedzialny także za budżet uczelni. Kanclerzem Viadriny jest pan Christian Zens.
Prorektorzy
Pierwszy zastępca rektor i
Prorektor d/s Międzynarodowych:
prof. dr Wolff Heintschel von Heinegg
Nauka i Collegium Polonicum:
Janine Nuyken
Badania i młoda kadra naukowa:
Prof. Dr. Cornelia Müller
Finanse i ekonomia:
Prof. Dr. Alfred Kötzle
Rektorat
Senat
Senat jest centralnym organem uczelni, składającym się z profesorów, studentów oraz pracowników naukowych i zwykłych.
Rady wydziałów
Rada Wydziału Prawa
Rada Wydziału Kulturoznawstwa
Rada Wydziału Ekonomii
Rzeczniczka ds. równouprawnienia
Rzecznik ds. równouprawnienia, p. Marion Gerhardt, zajmuje się kwestiami równouprawnienia kobiet i mężczyzn na uniwersytecie.
Rzeczniczka ds. obcokrajowców
Dr Carmen Thiele, reprezentuje interesy obcokrajowców na Uniwersytecie Europejskim Viadrina oraz udziela im konsultacji.
Rzeczniczka ds. niepełnosprawnych